Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNAL1Q9UBT7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms