Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX3Q9UBR4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX3Q9UBR4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX3Q9UBR4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX3Q9UBR4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX3Q9UBR4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX3Q9UBR4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX3Q9UBR4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX3Q9UBR4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX3Q9UBR4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX3Q9UBR4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX3Q9UBR4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX3Q9UBR4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX3Q9UBR4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX3Q9UBR4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX3Q9UBR4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX3Q9UBR4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX3Q9UBR4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX3Q9UBR4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX3Q9UBR4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX3Q9UBR4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX3Q9UBR4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX3Q9UBR4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LHX3Q9UBR4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
LHX3Q9UBR4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms