Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms