Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASF1BQ9NVP2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms