Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms