Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms