Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSTN2Q9H4D0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms