Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCOLN1Q9GZU1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms