Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLIRPQ9GZT3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms