Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J8

WDR33, pre-mRNA 3' end processing protein WDR33, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR33Q9C0J8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR33Q9C0J8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms