Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ROPN1BQ9BZX4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ROPN1BQ9BZX4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms