Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
YTHDF1Q9BYJ9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms