Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
KDM5DQ9BY66 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms