Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PBDC1Q9BVG4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms