Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms