Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms