Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms