Protein–RNA interactions for Protein: Q96S16

JMJD8, JmjC domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD8Q96S16 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JMJD8Q96S16 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms