Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ALS2CR12Q96Q35 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms