Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms