Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCZQ96LD1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCZQ96LD1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCZQ96LD1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCZQ96LD1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCZQ96LD1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCZQ96LD1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCZQ96LD1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCZQ96LD1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCZQ96LD1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SGCZQ96LD1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SGCZQ96LD1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCZQ96LD1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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