Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX22Q96L94 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms