Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms