Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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SPC24Q8NBT2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
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SPC24Q8NBT2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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SPC24Q8NBT2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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SPC24Q8NBT2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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SPC24Q8NBT2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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SPC24Q8NBT2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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SPC24Q8NBT2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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SPC24Q8NBT2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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SPC24Q8NBT2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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SPC24Q8NBT2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPC24Q8NBT2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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