Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SV2AQ7L0J3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms