Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSTM1Q6UX27 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms