Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATG16L1Q676U5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATG16L1Q676U5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms