Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms