Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF2Q5BJF6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms