Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms