Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GEN1Q17RS7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
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