Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6AP1Q15904 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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