Protein–RNA interactions for Protein: Q156A1

ATXN8, Ataxin-8, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8Q156A1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATXN8Q156A1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms