Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.182e-11■■□□□ 14
PCBP1Q15365 PELP1-211ENST00000573523 3878 ntTSL 213.72□□□□□ -0.212e-11■■□□□ 14
PCBP1Q15365 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.272e-11■■□□□ 14
PCBP1Q15365 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.292e-11■■□□□ 14
PCBP1Q15365 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.462e-6■■□□□ 14
PCBP1Q15365 TUBA1B-205ENST00000549870 565 ntTSL 413.34□□□□□ -0.278e-13■■□□□ 14
PCBP1Q15365 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.571e-8■■□□□ 14
PCBP1Q15365 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.731e-8■■□□□ 14
PCBP1Q15365 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.51e-8■■□□□ 14
PCBP1Q15365 PYCR2-206ENST00000478402 3149 ntTSL 215.12■□□□□ 0.011e-8■■□□□ 14
PCBP1Q15365 AL354993.2-201ENST00000558738 542 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.354e-7■■□□□ 14
PCBP1Q15365 TOP1-201ENST00000361337 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.979e-7■■□□□ 14
PCBP1Q15365 PTBP1-212ENST00000587136 583 ntTSL 323.36■■□□□ 1.332e-8■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 PTBP1-219ENST00000621737 1125 ntTSL 521.91■■□□□ 1.12e-8■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 PTBP1-208ENST00000585956 767 ntTSL 321.66■■□□□ 1.062e-8■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 PTBP1-215ENST00000589883 683 ntTSL 321.31■■□□□ 12e-8■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 PTBP1-205ENST00000585535 314 ntTSL 312.78□□□□□ -0.362e-8■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 ADAMTSL4-206ENST00000489159 1803 ntTSL 218.76■□□□□ 0.594e-12■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 A2M-203ENST00000462568 546 ntTSL 24.13□□□□□ -1.751e-323■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.264e-20■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.569e-8■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.539e-8■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.539e-8■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.539e-8■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.539e-8■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.539e-8■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.539e-8■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.539e-8■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 IL32-210ENST00000525377 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.43■□□□□ 0.389e-8■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.389e-8■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.389e-8■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.359e-8■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.349e-8■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.349e-8■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.299e-8■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.299e-8■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.289e-8■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 IL32-230ENST00000551122 733 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.099e-8■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 IL32-204ENST00000396887 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.199e-8■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 IL32-229ENST00000549213 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.459e-8■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 AC092073.1-201ENST00000592740 625 ntAPPRIS P1 TSL 319.24■□□□□ 0.677e-10■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 GPI-204ENST00000586392 1706 ntTSL 216.65■□□□□ 0.267e-10■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 GPI-203ENST00000586077 3053 nt10.5□□□□□ -0.733e-11■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.162e-6■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.674e-6■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 NOTUM-202ENST00000425009 996 ntTSL 327.03■■□□□ 1.921e-8■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 NOTUM-203ENST00000477214 813 ntTSL 526.17■■□□□ 1.783e-8■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 KCNH2-204ENST00000461280 2430 ntTSL 1 (best)19.68■□□□□ 0.742e-7■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 KCNH2-206ENST00000532957 3374 ntTSL 218.36■□□□□ 0.532e-7■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 KCNH2-205ENST00000473610 2782 ntTSL 217.86■□□□□ 0.452e-7■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.391e-6■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 TKFC-210ENST00000529479 1781 ntTSL 1 (best)21.15■□□□□ 0.982e-6■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 TJP2-205ENST00000423935 614 ntTSL 221.04■□□□□ 0.961e-6■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 RPN1-208ENST00000497415 547 ntTSL 420.77■□□□□ 0.921e-6■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.772e-6■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 PLOD1-204ENST00000449038 762 ntTSL 518.89■□□□□ 0.611e-6■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 RPN1-202ENST00000476931 526 ntTSL 418.77■□□□□ 0.61e-6■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.572e-6■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 RPL28-211ENST00000560881 1692 ntTSL 518.34■□□□□ 0.532e-6■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 PLOD1-203ENST00000429000 886 ntTSL 517.66■□□□□ 0.421e-6■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 RPS16-203ENST00000595386 1035 ntTSL 217.49■□□□□ 0.391e-6■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.361e-6■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.312e-6■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.311e-6■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.32e-6■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.32e-6■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.31e-6■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.222e-6■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.226e-7■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 PLOD1-208ENST00000485046 991 ntTSL 516.08■□□□□ 0.161e-6■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.124e-23■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.11e-6■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 PLOD1-202ENST00000358133 819 ntTSL 315.58■□□□□ 0.081e-6■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.021e-6■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 RPN1-204ENST00000481168 751 ntTSL 214.07□□□□□ -0.161e-6■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 RPS16-201ENST00000251453 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.34e-23■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.311e-6■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 TJP2-211ENST00000636247 3725 ntTSL 1 (best)12.9□□□□□ -0.341e-6■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 TJP2-201ENST00000348208 4058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.411e-6■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 TJP2-209ENST00000539225 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.51e-6■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 RPS16-206ENST00000601390 2389 ntTSL 211.68□□□□□ -0.544e-23■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 RPS16-208ENST00000602153 444 ntTSL 211.46□□□□□ -0.571e-6■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 RPS16-207ENST00000601655 492 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.624e-23■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 RPL28-201ENST00000344063 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.642e-6■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 RPS16-204ENST00000599539 555 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.684e-23■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 RPS16-205ENST00000599705 407 ntTSL 310.25□□□□□ -0.771e-6■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 FNDC3B-205ENST00000423424 408 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.991e-6■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 RPN1-206ENST00000495462 566 ntTSL 37.12□□□□□ -1.271e-6■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 PKMYT1-207ENST00000572059 880 ntTSL 517.87■□□□□ 0.459e-7■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 SLC3A2-220ENST00000542922 2174 ntTSL 214.16□□□□□ -0.141e-7■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 SLC3A2-214ENST00000539507 534 ntTSL 37.48□□□□□ -1.211e-7■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 NDUFC1-204ENST00000503453 682 ntTSL 319.43■□□□□ 0.74e-11■■□□□ 13.8
PCBP1Q15365 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.334e-11■■□□□ 13.8
PCBP1Q15365 NDUFC1-207ENST00000507764 838 ntTSL 217.09■□□□□ 0.334e-11■■□□□ 13.8
PCBP1Q15365 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.284e-11■■□□□ 13.8
PCBP1Q15365 NDUFC1-202ENST00000394225 664 ntTSL 216.81■□□□□ 0.284e-11■■□□□ 13.8
PCBP1Q15365 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.224e-11■■□□□ 13.8
PCBP1Q15365 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.124e-11■■□□□ 13.8
PCBP1Q15365 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.124e-11■■□□□ 13.8
PCBP1Q15365 NDUFC1-208ENST00000513022 564 ntTSL 414.4□□□□□ -0.14e-11■■□□□ 13.8
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