Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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PCM1Q15154 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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PCM1Q15154 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCM1Q15154 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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