Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GINS1Q14691 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms