Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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