Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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