Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NEUROD1Q13562 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEUROD1Q13562 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms