Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms