Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOP3AQ13472 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
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