Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB40BQ12829 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms