Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms