Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms