Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms