Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP2P81877 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms