Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP1P78357 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms