Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB1P62873 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB1P62873 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB1P62873 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB1P62873 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB1P62873 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB1P62873 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB1P62873 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB1P62873 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB1P62873 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB1P62873 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB1P62873 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB1P62873 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB1P62873 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB1P62873 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB1P62873 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB1P62873 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB1P62873 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB1P62873 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB1P62873 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB1P62873 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB1P62873 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB1P62873 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB1P62873 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB1P62873 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB1P62873 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB1P62873 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB1P62873 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB1P62873 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB1P62873 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB1P62873 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GNB1P62873 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GNB1P62873 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GNB1P62873 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GNB1P62873 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GNB1P62873 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GNB1P62873 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB1P62873 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB1P62873 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB1P62873 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB1P62873 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB1P62873 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB1P62873 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB1P62873 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB1P62873 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB1P62873 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB1P62873 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB1P62873 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB1P62873 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB1P62873 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB1P62873 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB1P62873 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB1P62873 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB1P62873 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB1P62873 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB1P62873 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB1P62873 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB1P62873 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB1P62873 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB1P62873 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB1P62873 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB1P62873 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB1P62873 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB1P62873 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB1P62873 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB1P62873 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB1P62873 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB1P62873 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB1P62873 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB1P62873 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB1P62873 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB1P62873 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 681.2 ms