Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RPS4XP62701 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS4XP62701 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS4XP62701 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS4XP62701 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS4XP62701 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS4XP62701 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS4XP62701 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS4XP62701 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS4XP62701 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS4XP62701 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS4XP62701 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms