Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIPPLY3P57055 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms